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  • 1分钟看懂差异表达基因结果

    想研究某现象的分子机制,老板豪气的来一句,先测个转录组吧,看下差异表达基因。是否在心里窃喜,制个样就完事了,太easy有木有。等大堆数据回来的时候,是不是傻眼了?   从何下手挑选差异表达基因呢?今天就先来聊聊如何看差异表达基因数据,火山图,聚类图又怎么看。...
    2016年09月21日 / 742 人围观 / 抢占沙发
  • 如何寻找非编码RNA与疾病的关系

    上次LncRNA的麻烦解决没过几天,骨头这个小胖子又开始愁眉不展。问了一下原因原来是骨头的导师有一个miRNA和一个LncRNA的课题要结题了,可是实验还没有阳性Data,让骨头发挥主观能动性,找找有什么可做的方向,这可把骨头难为坏了。看在骨头这几天一直请本大侠吃复旦食堂,外加送...
    2016年09月21日 / 233 人围观 / 抢占沙发
  • 如何正确筛选可能调控的miRNA

    我叫林平之,是莫愁师姐的师弟,最近研究一个基因啦,想要看看有没有被什么MiRNA调控,但是预测了好多,经费有限,不能一百多个全都试吧…… 莫愁:那就多预测一些咯……然后用韦恩图来取交集啦。 小林子:师姐,啥是韦恩图? 莫愁:文献里不是很多嘛,就类似这样: ...
    2016年08月31日 / 273 人围观 / 抢占沙发
  • #数据库#Super Target药物靶点数据库介绍

    在药物-靶点研究过程中,我们经常需要依赖于各种数据库进行药物和靶点信息的查询,浏览,下载等。 记录药物-靶点的数据库很多,包括drugbank,promiscuous,STITCH等。今天为大家介绍另一种研究药物靶点的数据库Super Target 网址http://...
    2016年07月27日 / 323 人围观 / 抢占沙发
  • #专业术语#高通量RNA测序数据分析标准化方法的优缺评价

    随着越来越多测序数据的出现,林林种种的二代测序数据标准化的方法着实使得不少生信工作者们头疼。 这些方法不仅在所采用的偏差矫正的类型和数据分析策略上有很大不同,而且也很难对哪一种标准化的方法比较合适以及对下游分析造成的影响进行回答。 但这些方法都是要回答一个问题:测序数...
    2016年07月12日 / 414 人围观 / 抢占沙发
  • 〖生物技术〗单细胞测序方法大比拼

    在单细胞研究的大潮中,新的测序方法层出不穷。不过,很少有人对这些方法进行系统的比对。慕尼黑大学生物学家Wolfgang Enard最近领导团队,在小鼠胚胎干细胞的基因表达研究中比较了一些常用的单细胞测序方法,包括Smart-seq、CEL-seq、SCRB-seq和Drop-se...
    2016年06月29日 / 140 人围观 / 抢占沙发
  • #专业术语#表达谱数据标准化方法介绍

    在获得一套高通量数据例如表达谱数据,我们往往需要对数据进行一定的标准化处理。数据的标准化(normalization)是将数据按比例缩放,使之落入一个小的特定区间。 在某些比较和评价的指标处理中经常会用到,去除数据的单位限制,将其转化为无量纲的纯数值,便于不同单位或量级的指...
    2016年05月26日 / 177 人围观 / 抢占沙发